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2006年2月15日，财政部发布了39项企业会计准则，这标志着适应我国市场要求与国际惯例趋同的企业会计准则体系正式建立,新会计准则体系相对于旧会计准则体系在多个方面对存货产生影响。
一、对存货入账价值的影响
按新准则的要求存货应当按照成本进行初始计量。存货成本包括采购成本，加工成本和其他成本。
（一）对购入存货价值的影响
购入存货的成本是采购成本，通常包括购买价款，相关税费、运输费、装卸费、保险费以及其他可归属于采购成本的费用。在企业会计存货的核算中这一部分始终作为存货的成本在进行核算，没有太大的影响，但值得注意的是在商品流通企业存货核算中往往将采购过程中发生的运输费、装卸费、保险费、包装费、包储费、入库前的挑选整理费用等计入当期损益（营业费用），而且旧准则是认可这一会计处理的。新准则取消这一规定，意味着商品流通企业的存货成本构成不能再搞特殊化。因此对商品流通企业会计的核算有一定的影响。
（二）自制存货成本的影响
自制存货的成本主要指的是需加工的材料的采购成本,加工成本和其他成本。在新准则中明确规定了非正常消耗的直接材料，直接人工和制造费用应当在发生时确认为当期损益，不计入存货成本。因为这些费用的发生无助于存货达到场所和状态。
同时新准则允许将用于存货生产的借款费用资本化。新准则规定，应计入存货成本的借款费用，按照《企业会计准则第17号—借款费用》的规定处理。《企业会计准则第17号—借款费用》规定，企业发生的借款费用，可直接归属于符合资本化条件的资产时，应当予以资本化。这就意味着允许为生产大型机器设备船舶、飞机等生产周期较长且用于出售的资产所借入的款项所发生的利息资本化，计入存货价值，而不再直接计入损益，也就是可资本化的资产不再限于使用专门借款购建的固定资产。而这些在旧的企业会计准则中却是没有提到的。
（三）对投资者投入存货成本的影响
新准则与旧准则相比，投资者投入的存货成本确认不同。旧准则中规定投资者投入的存货，按照投资各方确认的价值作为实际成本入账。新准则规定，投资者投入的存货的成本，应当按照投资合同或协议约定的价值确定。但合同或协议约定价值不公允的除外。即应当按照公允价值来确定存货的成本。公允价值的确定是这次新制定的会计准则的一个亮点。原准则规定的投资者投入的存货的成本，人为可操纵性很大，容易造成存货资产不实，提供虚假的会计信息。
二、对存货发出计价方法的影响
新企业会计准则除对存货的入账价值产生影响外，对存货发出计价也产生了一定的影响。
首先从大的方面来看，新准则下，存货取消了“后进先出法”，规定企业应当采用先进先出法，加权平均法或者个别计价法确定发出存货的实际成本。这对生产周期较长的公司将产生一定的影响。原用“后进先出”法，且存货较多，周转率较低的公司。如家电、金属加工类等上市公司，若存货价格下跌，在明年年报存货核算法改变后，其利润可能出现大幅下降，对公司业绩将产生一定的影响。
其次从具体方面来看，对低值易耗品和包装物摊销方面有了新规定。新准则规定，只能采用一次转销法或者五五摊销法两种对低值易耗品和包装物进行摊销，计入相关资产的成本或者当期损益。原准则规定，企业应当采用系统合理的方法对低值易耗品和包装物进行摊销，计入成本费用。可选用的方法有一次转销法、五五摊销法、分次摊销法等。新准则不认可低值易耗品和包装物摊销的分次摊销法，因此将它们通过待摊费用列支，以后分期摊入相关资产成本或者当期损益的做法已经不再符合规定。新旧准则的变化，防止了利用低值易耗品和包装物摊销方法的变化，多计提或者少计提费用，减少了人为操纵利润的空产的有关规定，按期（月）计提折旧或摊销。存在减值迹象的，还应当适用资产减值的有关规定。
取得的租金收入，计入其他业务收入、主营业务收入等。对于与投资性房地产有关的后续支出，满足资产确认条件的，应当予以资本化，计入投资性房地产的成本；不满足资产确认条件的，予以费用化，在发生时计入当期损益。